Министерства имели управление в виде Кабинета Министров, что позволило руководить централизовано. Министерств также было меньше, чем Коллегий. Всего было создано 8 Министерств для управления определенными сферами в государстве: военное, юстиции, коммерции, финансов, народного просвещения, иностранных дел, морское, внутренних дел. Когда пропала надобность в Негласном Комитете, который занимался подготовкой реформ, заняли места в Министерствах.