Основные экологические проблемы полупустынь и пустынь — это опустынивание, дефицит воды, эрозия почв, снижение биоразнообразия и антропогенные воздействия. Опустынивание и эрозия приводят к утрате плодородных земель, а нехватка воды и исчезновение растений угрожают жизни животных и людей. Влияние человека, включая добычу ресурсов и строительство, также ухудшает состояние этих экосистем.