Особенно важную роль в борьбе с ересями сыграли монашеские ордена доминиканцев и францисканцев. Доминиканцы, основанные в 1216 году святым Домиником, активно занимались миссионерской деятельностью и развивали инквизицию. Они стремились убедить людей в правильности католической веры и боролись с различными ересями, такими как альбигойская ересь. Францисканцы, основанные святым Франциском Ассизским в начале XIII века, также поддерживали папу, проповедуя бедность и смирение, призывая к возвращению к истинам католической веры. Эти ордена не только осуществляли духовное руководство, но и оказывали педагогическую помощь, обучая людей основам католицизма. Их работа значительно укрепила позиции папства в Европе и способствовала возвращению к доминирующей роли католической церкви.