Слово "насквозь" с непроизносимым согласным "з" в корне слова проверяется с помощью таких однокоренных слов как, например "сквозит/сквозят/сквозящий", при произношении которых становится очевидным, какая согласная должна быть в корне слова.
Может быть использовано любое однокоренное слово, где после непроизносимой в случае проверяемого слова согласной идет гласная буква.