Основные процессы горообразования, в результате которых образовались Кордильеры, происходили в Северной Америке с конца Юрского периода до начала Палеогена, в Южной Америке — с середины Мелового периода, активно продолжаясь в Кайнозойской эре. На сегодняшний день формирование горной системы не завершилось, что подтверждается частыми землетрясениями и высокоинтенсивными вулканическими процессами