Во-первых, снизилась роль Земских соборов, последний из которых при царе собирался в 1653 г. для обсуждения вхождения украинских территорий в состав России. Во-вторых, государь учредил Приказ тайных дел, подчинив его себе. Приказ вел усиленный надзор за деятельностью центральных и местных органов власти. В-третьих, снизилось влияние на государственные дела Боярской думы. В-четвертых, царь отверг предложение патриарха Никона о совместном правлении, где роль церковной власти была бы выше светской.